Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms