Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAN3Q58A45 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms