Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms