Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT16Q17RD7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT16Q17RD7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT16Q17RD7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT16Q17RD7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT16Q17RD7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT16Q17RD7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYT16Q17RD7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYT16Q17RD7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYT16Q17RD7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYT16Q17RD7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT16Q17RD7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms