Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms