Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms