Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms