Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDF5P43026 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms