Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 NIPBL-204ENST00000504430 3455 ntTSL 25.03□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.772e-7■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 HDAC10-204ENST00000429374 1634 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.757e-8■■■■■ 135
SF3B1O75533 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.577e-8■■■■■ 135
SF3B1O75533 HDAC10-206ENST00000454936 1922 ntTSL 218.44■□□□□ 0.547e-8■■■■■ 135
SF3B1O75533 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 135
SF3B1O75533 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 135
SF3B1O75533 YWHAZ-218ENST00000521607 750 ntTSL 33.19□□□□□ -1.97e-7■■■■■ 135
SF3B1O75533 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.927e-7■■■■■ 135
SF3B1O75533 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 134.9
SF3B1O75533 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 134.9
SF3B1O75533 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 134.9
SF3B1O75533 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.943e-6■■■■■ 134.7
SF3B1O75533 C8orf44-SGK3-201ENST00000519289 2949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 134.7
SF3B1O75533 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 134.6
SF3B1O75533 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 134.6
SF3B1O75533 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 134.6
SF3B1O75533 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 134.6
SF3B1O75533 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 134.6
SF3B1O75533 PHKB-203ENST00000563376 697 ntTSL 314.86□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 134.5
SF3B1O75533 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 134.5
SF3B1O75533 DCAF13-206ENST00000521999 779 ntTSL 514.69□□□□□ -0.065e-6■■■■■ 134.5
SF3B1O75533 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.145e-6■■■■■ 134.5
SF3B1O75533 DCAF13-208ENST00000612750 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 134.5
SF3B1O75533 DCAF13-205ENST00000521971 2049 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 134.5
SF3B1O75533 DCAF13-203ENST00000519682 837 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.935e-6■■■■■ 134.5
SF3B1O75533 DCAF13-202ENST00000518554 5300 ntTSL 27.4□□□□□ -1.235e-6■■■■■ 134.5
SF3B1O75533 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.235e-6■■■■■ 134.5
SF3B1O75533 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 512.93□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 134.5
SF3B1O75533 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 134.4
SF3B1O75533 SPRED2-208ENST00000474228 876 ntTSL 311.1□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 134.4
SF3B1O75533 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 134.4
SF3B1O75533 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 134.4
SF3B1O75533 HDLBP-208ENST00000422080 578 ntTSL 319.52■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 134.3
SF3B1O75533 HDLBP-212ENST00000426343 594 ntTSL 419.52■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 134.3
SF3B1O75533 HDLBP-244ENST00000490697 581 ntTSL 419.52■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 134.3
SF3B1O75533 HDLBP-223ENST00000449864 529 ntTSL 517.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 134.3
SF3B1O75533 HDLBP-224ENST00000452065 996 ntTSL 512.03□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 134.3
SF3B1O75533 HDLBP-227ENST00000458564 420 ntTSL 311.58□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 134.3
SF3B1O75533 HDLBP-213ENST00000427007 459 ntTSL 311.29□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 134.3
SF3B1O75533 HDLBP-219ENST00000442714 569 ntTSL 411.2□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 134.3
SF3B1O75533 HDLBP-222ENST00000449504 566 ntTSL 58.03□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 134.3
SF3B1O75533 RAP1GAP-208ENST00000464457 409 ntTSL 39.28□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 134.2
SF3B1O75533 BTK-210ENST00000621635 2767 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 134.2
SF3B1O75533 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 134.2
SF3B1O75533 BTK-202ENST00000372880 2248 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 134.2
SF3B1O75533 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 134.2
SF3B1O75533 SNUPN-211ENST00000569817 1023 ntTSL 317.07■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 134
SF3B1O75533 EPS15L1-208ENST00000595845 567 ntTSL 214.98□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 134
SF3B1O75533 EPS15L1-211ENST00000597559 743 ntTSL 29.4□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 134
SF3B1O75533 EPS15L1-216ENST00000602151 420 ntTSL 29.28□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 134
SF3B1O75533 SNUPN-204ENST00000564086 644 ntTSL 27.95□□□□□ -1.143e-8■■■■■ 134
SF3B1O75533 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 133.9
SF3B1O75533 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -24e-6■■■■■ 133.9
SF3B1O75533 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 133.9
SF3B1O75533 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 133.9
SF3B1O75533 ARNT-204ENST00000471844 3703 ntTSL 213.42□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 133.9
SF3B1O75533 ARNT-208ENST00000505755 2427 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 133.9
SF3B1O75533 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 133.9
SF3B1O75533 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.635e-6■■■■■ 133.9
SF3B1O75533 GNGT1-205ENST00000455502 1943 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 133.8
SF3B1O75533 NOL4L-208ENST00000475781 1127 ntTSL 518.16■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 133.8
SF3B1O75533 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 133.8
SF3B1O75533 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.654e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TTC19-208ENST00000497842 1360 ntTSL 530.46■■■□□ 2.474e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.374e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PRELID2-209ENST00000515475 582 ntTSL 429.66■■■□□ 2.344e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.234e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.144e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CCDC61-206ENST00000596687 800 ntTSL 527.47■■□□□ 1.992e-13■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.984e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TTC19-204ENST00000470399 636 ntTSL 527.12■■□□□ 1.934e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.924e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.914e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.854e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 THOP1-204ENST00000585673 784 ntTSL 326.2■■□□□ 1.794e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 INPPL1-202ENST00000320683 717 ntTSL 226.04■■□□□ 1.764e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.764e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.744e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PRNP-204ENST00000457586 855 ntTSL 1 (best)25.82■■□□□ 1.724e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SEPT5-203ENST00000406172 1996 ntTSL 525.53■■□□□ 1.681e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SMARCD1-209ENST00000550477 911 ntTSL 325.53■■□□□ 1.684e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.684e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SUMO3-205ENST00000466861 753 ntTSL 225.34■■□□□ 1.654e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DDX41-202ENST00000503078 2375 ntTSL 225.19■■□□□ 1.624e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MRPL9-205ENST00000467306 1264 ntTSL 225.07■■□□□ 1.64e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AP1AR-204ENST00000506522 390 ntTSL 225.06■■□□□ 1.64e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MTA1-209ENST00000469140 1666 ntTSL 524.97■■□□□ 1.594e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TFPT-204ENST00000420715 737 ntTSL 524.95■■□□□ 1.584e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.584e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.584e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ANXA5-206ENST00000511552 1036 ntTSL 324.73■■□□□ 1.554e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TTC19-210ENST00000583704 552 ntTSL 224.62■■□□□ 1.534e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MMAB-207ENST00000541763 1252 ntTSL 324.53■■□□□ 1.524e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.514e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AP1AR-205ENST00000510527 1044 ntTSL 1 (best)24.47■■□□□ 1.514e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TTC19-203ENST00000466729 908 ntTSL 524.09■■□□□ 1.454e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SMARCD1-212ENST00000551966 881 ntTSL 524■■□□□ 1.434e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MCF2L2-209ENST00000475664 460 ntTSL 323.89■■□□□ 1.424e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CAPN2-208ENST00000483579 496 ntTSL 223.62■■□□□ 1.374e-6■■■■■ 133.7
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1538.2 ms