Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms