Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLTPD2A6NH11 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLTPD2A6NH11 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLTPD2A6NH11 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLTPD2A6NH11 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLTPD2A6NH11 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLTPD2A6NH11 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLTPD2A6NH11 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLTPD2A6NH11 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms