Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms