Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms