Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms