Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NUDCD1Q96RS6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NUDCD1Q96RS6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms