Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAMP1Q96JM3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms