Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP13Q92995 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP13Q92995 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP13Q92995 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP13Q92995 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP13Q92995 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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