Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D1Q8WV19 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms