Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms