Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms