Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUPD1Q68J44 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms