Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QL3Q5VWW1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms