Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms