Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTUD4Q01804 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms