Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYBPC1Q00872 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms