Protein–RNA interactions for Protein: P53816

PLA2G16, HRAS-like suppressor 3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G16P53816 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLA2G16P53816 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLA2G16P53816 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms