Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms