Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms