Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNCRIPO60506 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms