Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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