Protein–RNA interactions for Protein: O00560

SDCBP, Syntenin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBPO00560 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDCBPO00560 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms