Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A6NIN4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NIN4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NIN4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A6NIN4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms