Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf49A4QMS7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms