Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ERG28Q9UKR5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms