Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 342.7 ms