Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms