Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms