Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms