Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms