Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms