Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms