Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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