Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms