Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC2Q6ZN30 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC2Q6ZN30 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms