Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD1Q6UXZ0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms