Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms