Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALFQ53S48 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms