Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RNF212Q495C1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RNF212Q495C1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RNF212Q495C1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF212Q495C1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RNF212Q495C1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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