Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms