Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIP13Q15645 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIP13Q15645 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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